日本は今後、温暖化の影響でお米の品質の低下に悩まされることを見越して、九州農業試験場（現・独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構九州沖縄農業研究センター）で1996年から交配が行われました。九州のブランド米で西日本で広く普及しており、品質・収量に優れる「ヒノヒカリ」に代わる品種として、2005年に「にこまる」は誕生しました。長崎県が生産量一位となっています。